生命学院陈佳课题组与合作者揭示碱基编辑器的效能差异并构建可编辑致病突变数据库
近日,中科院上海营养与健康研究院杨力研究员(我校特聘教授)与我校生命学院陈佳教授课题组开展合作研究,系统性揭示了一系列具有代表性的基因组碱基编辑器(base editor)的效能差异,并进一步构建了可利用20种已报道碱基编辑器进行编辑的人类疾病相关单碱基突变位点的数据库(BEable-GPS, Base Editable prediction of Global Pathogenic SNVs),相关成果以“Comparison of cytosine base editors and development of the BEable-GPSdatabase for targeting pathogenic SNVs” 为题,近日在国际知名学术期刊Genome Biology上在线发表。由CRISPR/Cas基因编辑酶(如Cas9, Cpf1等)与胞嘧啶脱氨编辑酶(如APOBEC等)整合而成的胞嘧啶碱基编辑系统,可在单碱基水平实现高效率的靶向C-to-T编辑。理论上来讲,这种碱基编辑效果的实现不依赖于DNA双链切割活性,可避免对基因组造成损伤,因此具有较高的安全性,未来有望运用于人类疾病相关单碱基突变的定向矫正,在...
2019-11-06